ICAC首席調查主任陸志廉（古天樂 飾）與總調查主任程德明（鄭嘉穎 飾）共同調查走私貪污案，反貪風暴意外發現另一起涉及人口販賣的最終章海關貪腐大案。此案與恐襲集團首腦King及其幕後指使人肖卓亞（謝天華 飾）有關，反貪風暴並牽涉多名香港海關高層領導，最終章且似乎與受邀到香港、反貪風暴被JFIU廖保強（張智霖 飾）秘密保護的最終章亞洲首席大法官龐愛瑪（宣萱 飾）也有聯系。暗流湧動、反貪風暴撲朔迷離，最終章反貪風暴真相究竟何時浮現……