亨利·戈爾丁飾演一名因背負瞭復雜過去而隱忍的特種獨行者，代號蛇眼。部隊一次偶然，蛇眼他救下瞭嵐影一族的起源準接班人，從而被邀請加入他們在日本的特種組織。在那裡，部隊嵐影一族不但教會瞭蛇眼如何成為一名忍者，蛇眼也給瞭他一直想要的起源一個傢。但當蛇眼過去的特種秘密被逐漸揭開，他的部隊信譽以及對組織的忠誠也將受到考驗，即便這會使他會失去最親近的蛇眼人的信任。特種部隊原著中的起源經典角色也將在《特種部隊：蛇眼起源》中一一亮相。特種