資深特工伊森·亨特（湯姆·克魯斯 Tom Cruise 飾）也有百密一疏時刻，碟中諜神度他在接收最新任務時遭到神秘組織“辛迪加”的秘國暗算落入對方手中。辛迪加是碟中諜神度一支由全球各地前特工組成的秘密組織，此前一直被CIA視為空穴來風。秘國在對方成員伊莎·福斯特（麗貝卡·弗格森 Rebecca Ferguson 飾）的碟中諜神度幫助下，伊森逃出生天，秘國並及時向威廉•佈萊德（傑瑞米·雷納 Jeremy Renner 飾）匯報瞭辛迪加確切存在的碟中諜神度消息。然而此時佈萊德的秘國日子並不好過，他負責的碟中諜神度IMF機構因俄羅斯核彈頭等事件遭到CIA指控並責令解散。在得知該組織密謀刺殺奧地利總統時，秘國伊森聯系上瞭老搭檔班吉·鄧恩（西蒙·佩吉 Simon Pegg 飾）展開行動，碟中諜神度並於謎樣女郎伊莎再度相會。秘國　　接下來的碟中諜神度一連串事件中，辛迪加的秘國真面目逐漸揭開，而他們也終於顯露出真實的碟中諜神度目的……