二十世紀最後的拉怪夏天。那一天，獸行人類終於知道自己並非地球這顆行星唯一的拉怪統治者。　　巨型生物「怪獸」，獸行以及驅逐怪獸的拉怪終極存在「哥斯拉」出現瞭。經歷與怪獸之間長達半個世紀的獸行戰爭，人類屢戰屢敗，拉怪最終計劃逃出地球。獸行2048年，拉怪經過中央政府管理的獸行人工智能篩選，一部分人類乘坐跨恒星移民飛船「阿拉特拉姆」號踏上瞭前往11.9光年之外的拉怪「鯨魚座τ星e」的旅程。然而，獸行人類花費20年所抵達的拉怪星球與地球之間的環境差距遠超預期，不適宜人類生存。獸行　　移民飛船上有一名青年——晴雄。拉怪4歲的時候，他親眼目睹父母被哥斯拉殺害。20年來他始終想著回到地球消滅哥斯拉。移民的可能性已經灰飛煙滅，飛船內的生存環境也越發惡劣，以晴雄為中心的「重返地球派」成為主流，他們決定經過危險的長距離亞空間航行返回地球。　　然而，地球經過2萬年的演化已經形成瞭以哥斯拉為頂端的生態體系，完全成為瞭一個未知世界。　　最終人類能否奪回地球？晴雄的命運又將如何？